Філогенетика та молекулярна еволюція

 

Що має навчити дисципліна:

  1. Основні поняття молекулярної еволюції
  • Практична. Database searching by sequence similarity. Blast, FastA
  1. Вирівнювання нуклеотидних послідовностей (Множинне вирівнювання послідовностей).
  • Практична. Clustal, T-Coffee, Muscle, порівняння алайнментів за допомогою веб-інструменту AltAVIsT.
  1. Генетичні відстані та моделі заміни нуклеотидів
  2. Філогененія на основі методів генетичних відстаней та максимальної подібності.
  3. Байєсівський філогенетичний аналіз
  4. Філогенія на основі принципу персимонії
  5. Філогенетичний аналіз з використанням білкових послідовностей
  6. Вибір еволюційних моделей
  7. Молекулярний годинник
  8. Тестування топології філогенетичних дерев
  9. Молекулярна адаптація. Оцінка тиску селекції (природного добору) на вирівнювання кодуючих послідовностей
  10. Рекомбінації. Виявлення та характеристика окремих подій рекомбінації.

 

Викладач:  Віктор Шпарик